La norma ISO 22000:2005 está estructurada siguiendo el esquema de otras normas ISO como las de la serie 9000, por lo que su proceso de implantación es muy similar, con las diferencias debidas a la parte que tiene de seguridad alimentaria, en especial los procesos relacionados con la Planificación y Realización de Productos Inocuos. Asimismo, la norma ISO 22000:2005 introduce dentro de su estructura el Plan APPCC tradicional de muchas organizaciones alimentarias.

La norma es un sistema estandarizado y estructurado, por lo que no tienen por qué aplicar de igual manera a diferentes organizaciones. Uno de los objetivos preliminares para desarrollar e implantar un sistema de gestión eficaz es que, respetando el esquema básico y los requisitos, debe ser individualizado hasta el último detalle para cada organización.

Por esto las etapas de implantación descritas en este capítulo hay que considerarlas como una orientación, siendo necesario personalizarlas después para cada organización donde se vaya a implantar la norma ISO 22000.

En cada una de las etapas o pasos de la implantación se irá generando la documentación necesaria para su desarrollo, implantación, implementación, mantenimiento y mejora, cumpliendo los requisitos de la norma, los legales y las necesidades de la organización.